macOS 系统上的 FreeSurfer 安装指南82

FreeSurfer 是一个开源软件套件，用于对大脑进行磁共振成像 (MRI) 数据进行分析和可视化。尽管它最初是为 Linux 系统开发的，但 FreeSurfer 也可以在 macOS 系统上安装和使用。

先决条件* macOS 10.12 或更高版本
* 至少 16 GB RAM
* 至少 100 GB 可用硬盘空间
* Xcode 10 或更高版本（用于编译）
* Python 3.6 或更高版本
* Java 8 或更高版本

安装步骤1. 安装 Xcode 和 Command Line Tools
* 从 App Store 安装 Xcode。
* 通过终端运行以下命令安装 Command Line Tools：`xcode-select --install`
2. 安装 Homebrew
* Homebrew 是一个 macOS 包管理器。通过终端运行以下命令安装 Homebrew：`/bin/bash -c "$(curl -fsSL /Homebrew/install/HEAD/)"`
3. 使用 Homebrew 安装 FreeSurfer
* 运行以下命令使用 Homebrew 安装 FreeSurfer：`brew install freesurfer`
4. 编译和安装 FreeSurfer
* FreeSurfer 需要编译和安装。在终端中运行以下命令：`cd /usr/local/freesurfer && ./build_src/build`
5. 设置环境变量
* 编译完成后，您需要设置一些环境变量以使 FreeSurfer 正常工作。在终端中运行以下命令：
```
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
export SUBJECTS_DIR=$FREESURFER_HOME/subjects
export FSLDIR=/usr/local/fsl
```
6. 安装 FSL
* FSL 是一个神经影像分析工具包，FreeSurfer 需要它才能正常工作。使用 Homebrew 安装 FSL：`brew install fsl`
7. 配置 FreeSurfer
* 使用以下命令配置 FreeSurfer：`recon-all -autorecon1`
* 这将创建一个示例数据集，您可以在其上运行 FreeSurfer。

测试 FreeSurfer* 要测试 FreeSurfer，请在终端中运行以下命令：`mri_convert /usr/local/freesurfer/subjects/fsaverage/mri/ `
* 这将创建一个 FreeSurfer 大脑图像的 NIfTI 文件。

其他提示* 如果您在安装或使用 FreeSurfer 时遇到问题，请查看 FreeSurfer 文档或加入 FreeSurfer 论坛。
* FreeSurfer 使用大量磁盘空间，因此确保您有足够的可用空间。
* FreeSurfer 是一款功能强大的工具，用于分析大脑 MRI 数据。如果您正在寻找一种研究大脑的工具，FreeSurfer 是一个不错的选择。

2024-10-19

上一篇：macOS 系统中彻底删除 iTunes

下一篇：华为勇闯操作系统领域，鸿蒙系统领军前行